La CNSS est placée sous la tutelle technique du Ministère en charge de la Protection sociale et sous la tutelle financière du Ministère en charge des finances.
Elle est administrée par un conseil d’administration tripartite de quinze (15) membres composé de :
– cinq (05) membres représentant l’État;
– cinq (05) membres représentant les organisations professionnelles d’employeurs;
– cinq (05) membres représentant les organisations syndicales des travailleurs.
Trois (03) observateurs dont deux (02) représentants les retraités et un (01) représentant le ministère en charge du commerce et de l’industrie.
Il a notamment pour rôle de :
– voter le budget ;
– approuver la structure administrative ;
– veiller au bon fonctionnement de la CNSS par l’exercice régulier de son contrôle.
Les services de la CNSS sont placés sous l’autorité d’un directeur général. Il assure la gestion quotidienne sous le contrôle du conseil d’administration. Il est ordonnateur du budget en recettes et en dépenses.